Так как я выбрал нестандартный путь установки — установка из под существующей основной системы Ubuntu, были сложности с правкой menu.lst

На заметку самому себе:

строка типа root (hd0,2) должна указывать тот раздел, где лежит ядро системы, которое я хочу загрузить

Например так:

title                      Gentoo
root                 (hd0,2)
kernel                   /boot/kernel-2.6.27-gentoo-r7 root=/dev/sda3 ro